Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax1P09084 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax1P09084 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms