Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa1P09022 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms