Protein–RNA interactions for Protein: P06799

Ifna7, Interferon alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna7P06799 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifna7P06799 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna7P06799 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms