Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa4P06798 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa4P06798 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa4P06798 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa4P06798 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa4P06798 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa4P06798 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa4P06798 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa4P06798 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa4P06798 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa4P06798 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa4P06798 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa4P06798 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa4P06798 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa4P06798 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa4P06798 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa4P06798 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxa4P06798 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa4P06798 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa4P06798 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa4P06798 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms