Protein–RNA interactions for Protein: P03953

Cfd, Complement factor D, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfdP03953 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CfdP03953 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CfdP03953 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CfdP03953 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CfdP03953 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CfdP03953 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CfdP03953 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CfdP03953 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CfdP03953 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CfdP03953 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CfdP03953 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CfdP03953 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CfdP03953 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CfdP03953 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CfdP03953 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CfdP03953 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CfdP03953 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CfdP03953 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CfdP03953 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CfdP03953 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CfdP03953 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CfdP03953 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CfdP03953 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CfdP03953 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CfdP03953 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CfdP03953 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CfdP03953 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CfdP03953 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CfdP03953 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CfdP03953 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CfdP03953 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CfdP03953 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CfdP03953 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CfdP03953 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CfdP03953 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CfdP03953 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CfdP03953 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CfdP03953 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CfdP03953 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CfdP03953 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CfdP03953 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CfdP03953 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CfdP03953 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CfdP03953 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CfdP03953 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CfdP03953 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CfdP03953 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CfdP03953 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CfdP03953 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CfdP03953 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CfdP03953 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CfdP03953 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CfdP03953 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CfdP03953 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CfdP03953 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CfdP03953 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CfdP03953 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CfdP03953 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CfdP03953 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CfdP03953 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CfdP03953 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CfdP03953 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CfdP03953 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CfdP03953 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CfdP03953 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CfdP03953 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CfdP03953 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CfdP03953 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CfdP03953 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CfdP03953 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CfdP03953 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CfdP03953 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CfdP03953 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CfdP03953 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CfdP03953 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CfdP03953 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CfdP03953 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CfdP03953 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CfdP03953 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CfdP03953 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CfdP03953 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CfdP03953 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CfdP03953 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms