Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-AaP01910 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms