Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01853 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01853 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01853 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01853 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01853 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01853 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01853 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01853 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01853 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01853 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01853 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01853 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01853 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01853 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01853 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01853 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01853 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01853 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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