Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01822 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01822 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01822 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01822 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01822 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01822 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01822 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01822 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01822 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01822 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01822 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01822 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01822 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01822 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01822 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01822 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01822 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01822 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01822 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01822 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01822 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01822 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01822 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01822 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01822 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01822 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01822 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01822 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01822 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01822 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01822 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01822 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01822 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01822 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01822 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
P01822 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01822 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01822 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01822 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
P01822 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01822 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01822 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01822 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01822 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01822 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01822 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01822 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01822 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01822 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01822 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01822 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01822 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01822 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01822 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01822 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01822 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01822 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01822 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01822 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01822 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01822 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01822 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01822 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01822 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms