Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01789 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01789 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01789 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01789 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01789 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01789 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01789 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01789 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01789 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01789 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01789 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01789 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01789 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01789 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01789 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01789 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01789 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01789 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01789 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01789 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01789 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01789 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01789 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01789 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01789 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01789 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01789 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01789 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01789 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01789 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01789 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01789 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01789 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01789 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01789 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01789 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01789 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01789 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01789 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01789 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01789 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01789 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01789 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01789 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01789 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01789 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01789 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01789 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01789 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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