Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01787 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01787 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01787 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01787 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01787 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01787 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01787 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01787 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01787 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01787 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01787 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01787 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01787 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01787 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01787 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01787 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01787 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01787 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01787 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01787 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01787 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01787 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01787 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01787 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01787 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01787 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01787 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01787 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01787 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01787 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01787 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01787 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01787 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01787 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01787 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01787 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01787 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01787 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01787 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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