Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01746 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01746 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01746 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01746 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01746 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01746 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01746 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01746 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P01746 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01746 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01746 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01746 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01746 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01746 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01746 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01746 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01746 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01746 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01746 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01746 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01746 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01746 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01746 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01746 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01746 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01746 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01746 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01746 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01746 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01746 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01746 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01746 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01746 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01746 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01746 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01746 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01746 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01746 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P01746 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01746 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01746 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01746 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01746 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01746 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01746 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01746 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01746 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01746 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01746 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01746 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01746 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
P01746 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01746 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01746 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01746 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01746 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01746 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01746 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01746 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01746 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01746 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms