Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01728 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01728 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01728 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01728 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01728 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01728 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01728 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01728 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01728 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01728 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01728 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01728 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01728 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01728 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01728 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01728 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01728 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01728 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01728 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01728 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01728 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01728 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01728 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01728 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01728 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01728 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01728 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01728 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01728 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01728 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01728 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01728 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01728 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01728 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01728 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01728 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01728 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01728 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01728 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01728 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01728 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01728 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01728 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01728 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01728 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01728 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01728 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01728 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01728 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01728 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01728 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01728 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01728 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01728 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01728 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01728 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01728 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01728 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01728 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01728 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01728 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01728 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01728 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01728 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01728 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01728 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01728 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01728 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01728 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01728 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01728 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01728 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01728 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01728 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01728 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01728 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01728 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01728 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01728 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms