Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms