Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apaf1O88879 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apaf1O88879 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms