Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nid2O88322 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nid2O88322 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nid2O88322 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nid2O88322 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nid2O88322 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nid2O88322 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nid2O88322 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nid2O88322 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nid2O88322 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nid2O88322 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nid2O88322 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nid2O88322 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms