Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm10509O88255 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm10509O88255 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm10509O88255 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm10509O88255 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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