Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt5hO55201 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt5hO55201 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.2 ms