Protein–RNA interactions for Protein: O55091

Impact, Protein IMPACT, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ImpactO55091 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ImpactO55091 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ImpactO55091 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ImpactO55091 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ImpactO55091 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ImpactO55091 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ImpactO55091 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ImpactO55091 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ImpactO55091 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms