Protein–RNA interactions for Protein: O55042

Snca, Alpha-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaO55042 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaO55042 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaO55042 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaO55042 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaO55042 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaO55042 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaO55042 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaO55042 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaO55042 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaO55042 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaO55042 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaO55042 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaO55042 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaO55042 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaO55042 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaO55042 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaO55042 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaO55042 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaO55042 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaO55042 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaO55042 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaO55042 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaO55042 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaO55042 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaO55042 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaO55042 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaO55042 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaO55042 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaO55042 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaO55042 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaO55042 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaO55042 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaO55042 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaO55042 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaO55042 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaO55042 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaO55042 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaO55042 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaO55042 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaO55042 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaO55042 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SncaO55042 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SncaO55042 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SncaO55042 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SncaO55042 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SncaO55042 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SncaO55042 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SncaO55042 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SncaO55042 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SncaO55042 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SncaO55042 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SncaO55042 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SncaO55042 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SncaO55042 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SncaO55042 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SncaO55042 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SncaO55042 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SncaO55042 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SncaO55042 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SncaO55042 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SncaO55042 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SncaO55042 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SncaO55042 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SncaO55042 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SncaO55042 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SncaO55042 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SncaO55042 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SncaO55042 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SncaO55042 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SncaO55042 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SncaO55042 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SncaO55042 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SncaO55042 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SncaO55042 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SncaO55042 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SncaO55042 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SncaO55042 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SncaO55042 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SncaO55042 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SncaO55042 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaO55042 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaO55042 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaO55042 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms