Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp100O35892 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp100O35892 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Sp100O35892 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp100O35892 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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