Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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