Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfibp2O35711 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp2O35711 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms