Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx8O35652 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx8O35652 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx8O35652 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx8O35652 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx8O35652 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx8O35652 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx8O35652 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx8O35652 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx8O35652 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx8O35652 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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