Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag2O35638 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag2O35638 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag2O35638 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stag2O35638 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stag2O35638 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag2O35638 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Stag2O35638 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag2O35638 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms