Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CrcpO35427 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CrcpO35427 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CrcpO35427 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrcpO35427 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CrcpO35427 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CrcpO35427 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CrcpO35427 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CrcpO35427 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CrcpO35427 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrcpO35427 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms