Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppef2O35385 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppef2O35385 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms