Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms