Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcof1O08784 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcof1O08784 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms