Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CltaO08585 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltaO08585 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltaO08585 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltaO08585 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltaO08585 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltaO08585 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltaO08585 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltaO08585 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltaO08585 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltaO08585 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CltaO08585 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltaO08585 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CltaO08585 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltaO08585 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CltaO08585 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltaO08585 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltaO08585 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltaO08585 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltaO08585 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltaO08585 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltaO08585 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltaO08585 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltaO08585 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CltaO08585 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CltaO08585 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CltaO08585 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CltaO08585 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CltaO08585 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CltaO08585 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CltaO08585 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CltaO08585 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CltaO08585 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CltaO08585 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CltaO08585 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltaO08585 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CltaO08585 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltaO08585 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltaO08585 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltaO08585 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CltaO08585 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CltaO08585 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CltaO08585 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CltaO08585 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CltaO08585 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CltaO08585 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltaO08585 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltaO08585 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltaO08585 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltaO08585 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltaO08585 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CltaO08585 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltaO08585 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltaO08585 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltaO08585 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltaO08585 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltaO08585 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltaO08585 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltaO08585 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltaO08585 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltaO08585 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltaO08585 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CltaO08585 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltaO08585 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltaO08585 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltaO08585 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltaO08585 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltaO08585 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltaO08585 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CltaO08585 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltaO08585 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltaO08585 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltaO08585 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltaO08585 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CltaO08585 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltaO08585 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltaO08585 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CltaO08585 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CltaO08585 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CltaO08585 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltaO08585 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltaO08585 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltaO08585 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltaO08585 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltaO08585 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltaO08585 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CltaO08585 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CltaO08585 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CltaO08585 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CltaO08585 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CltaO08585 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CltaO08585 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CltaO08585 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CltaO08585 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltaO08585 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltaO08585 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltaO08585 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CltaO08585 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltaO08585 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltaO08585 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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