Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms