Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21310J3QQ23 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm21310J3QQ23 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm21310J3QQ23 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm21310J3QQ23 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm21310J3QQ23 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm21310J3QQ23 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm21310J3QQ23 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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