Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20877J3QPZ4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms