Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccer2J3QPU5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccer2J3QPU5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms