Protein–RNA interactions for Protein: J3QP01

Gm5108, Predicted gene 5108, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5108J3QP01 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5108J3QP01 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5108J3QP01 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5108J3QP01 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5108J3QP01 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5108J3QP01 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5108J3QP01 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5108J3QP01 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5108J3QP01 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5108J3QP01 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5108J3QP01 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms