Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cldn34c2J3QNM1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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