Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm17577J3QNF7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm17577J3QNF7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm17577J3QNF7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm17577J3QNF7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm17577J3QNF7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Gm17577J3QNF7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Gm17577J3QNF7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Gm17577J3QNF7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Gm17577J3QNF7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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