Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21244J3QK38 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21244J3QK38 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms