Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
7530416G11RikJ3QJX6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms