Protein–RNA interactions for Protein: J3KMT3

Gm6882, Predicted gene 6882, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6882J3KMT3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6882J3KMT3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6882J3KMT3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms