Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r12G5E8G1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms