Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfgef1G3X9K3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgef1G3X9K3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms