Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms