Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5218F6YH22 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5218F6YH22 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms