Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10563F6WIE4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm10563F6WIE4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm10563F6WIE4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms