Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Phldb3E9QAF4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phldb3E9QAF4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms