Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9N3

Vmn1r152, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r152E9Q9N3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r152E9Q9N3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r152E9Q9N3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r152E9Q9N3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r152E9Q9N3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r152E9Q9N3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r152E9Q9N3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r152E9Q9N3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r152E9Q9N3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r152E9Q9N3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r152E9Q9N3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r152E9Q9N3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r152E9Q9N3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r152E9Q9N3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r152E9Q9N3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms