Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms