Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700024B05RikE9Q6D7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms