Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdhb9E9Q5G2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms