Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms